お掃除機能は、フィルターの表面に付いたホコリをブラシでかき取って取り除く機能です。内部クリーン運転は、冷房や除湿運転の停止後、結露した熱交換器やその周辺の水分を乾かすために自動で送風運転する機能です。より素早く乾燥させるため、送風に加えて暖房運転する機種もあります。
ただし、いずれの機能も万能ではなく、例えば、キッチンの近くに設置されているエアコンは、油煙を吸い込むため、フィルターに油汚れが溜まることがありますが、お掃除機能では、この油汚れをキレイにすることができません。また、熱交換器やドレンパン、ファンに付いたホコリやカビ汚れも内部クリーン機能ではキレイにすることができません。